Il viroide è un agente infettivo simile a un virus, scoperto nel 1971 da Theodor O. Diener; è costituito da una piccola molecola di RNA aploide circolare (alcune centinaia di nucleotidi) non rivestita da capside. I viroidi infettano i vegetali, e possono essere trasmessi mediante semi, pollini e strumenti agricoli. L’RNA non codifica nessuna proteina, ma presenta il fenomeno dell’RNA silencing, con cui causa danni alla cellula infettata; si replica mediante l’RNA polimerasi II della cellula con un intermedio replicativo a doppio filamento. L’unico virus con struttura simile a quella viroide è l’HDV, il virus dell’epatite D.